常用的电子束焊接接头是对接、角接、T形接、搭接和端接。电子束斑点直径小，能量集中，焊接时一般不加焊丝，设计接头时应注意这些特点。
对接接头是最常用的接头形式。图1a、b、c三种接头的准备工作简单，但需要装配夹具。不等厚的对接接头采用上表面对齐的设计优于台阶接头，后者在焊接时要用宽而倾斜的电子束(图1d)。带锁口的接头 (图1e、f)，便于装配对齐，锁口较小时，焊后可避免留下未焊合的缝隙。图1g、h接头皆有自动填充金属的作用，焊缝成形得到改善。斜对接接头只用于受结构和其他原因限制的特殊场合（图1i）。